一、先天性无阴茎畸形
本病是因生殖结节发育不全所致。先天性无阴茎畸形患者经常是短命的。对于能够成活下来的病人来说，最好的治疗方法是转回为女性，其手术包括睾丸切除及外阴成形等。
二、隐匿阴茎畸形
本病多见于肥胖体型的人(阴囊肿大造成者除外)。病人常因肥胖导致阴茎发育异常，出现包茎及阴茎发育短小等症。隐匿阴茎畸形治疗方法是进行综合性减肥治疗，必要时可实施阴茎成形术并辅以内分泌治疗。儿童患者应尽量在青春期前完成手术。
三、双阴茎畸形
本症是因胚胎期阴茎始基发育障碍所引起的，常合并其他畸形，如双膀胱、双直肠以及肛门、脊柱等部位的畸形。双阴茎畸形治疗比较简单，可保存较粗壮的一侧而将另一侧切除。
四、小阴茎畸形
一般以为，新生儿阴茎的长度小于1cm，进进青春期后阴茎长度小于5cm，直径亦较小，但尿道及开口正常者，即称为小阴茎畸形。利用微创手术通过改变阴茎浅悬韧带和深悬韧带，使生殖器官增长变粗，已达到整形目的
大阴茎畸形者的阴茎长度和直径均较正常者大，国内曾报道有阴茎长度达18cm，根部直径达3.5cm，阴茎头长3.5cm，头部直径达5.5cm者。大阴茎畸形病人还经常合并内分泌系统的其他疾病。 治疗这种病人一般是采用部分切除阴茎海绵体的缩小手术。
六、蹼状阴茎畸形
蹼状阴茎，是指阴茎皮肤全长附着于阴囊，而使阴茎无法勃起并影响排尿的一种畸形，一些病人还合并尿道下裂或性别畸形。蹼状阴茎畸形可根据具体情况选择阴茎成形术或尿道下裂修补术进行治疗。
七、阴茎的弯曲畸形
先天性阴茎弯曲，是因阴茎海绵体发育障碍所引起的畸形，阴茎呈向股侧弯曲。Devine(1973)根据病变组织的部位与性质将先天性阴茎弯曲划分为三型，即：尿道海绵体及其四周筋膜缺如型、Buck筋膜与白膜发育不良型和内膜发育不良型，其中的尿道海绵体缺如型的弯曲最为严重。本病病人的主要症状是阴茎弯曲，同时伴有排尿及性生活障碍。阴茎的弯曲畸形治疗方法主要是实施包括切除影响阴茎伸直组织在内的阴茎整形术。
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